航天母舰还能作为高能激光武器、粒子束武器、动能武器等太空攻击武器的发射平台，用以拦截摧毁宇宙空间的导弹、卫星和飞船等军事目标。 航天母舰上的武器与陆地上或飞机上所使用的武器不同。除了导弹、火箭外，主要使用一种叫做定向束能的武器。这种武器射出的不是炮弹，而是用加速器发射的高速电子、质子和重离子等带电粒子流，攻击目标的要害部位，使之软化、变形、穿透、烧毁。激光炮是其中威力最大的一种，但它发射的是激光束，在其作用的极小面积上产生相当于原子弹1
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